C'est l'année de la destinée et Kamui Shirō, un puissant psychicien de 15 ans, est retourné à Toyko après une absence de 6 ans. Il retourne pour protéger ses amis d'enfance, mais le destin s'empare de lui et de ses proches. C'est sa destinée de décider du sort du monde et de l'humanité, peu importe s'il veut ou non le rôle.
Dans un avenir proche, des créatures nommées "Huge" apparaissent sur Terre et menacent de détruire la planète. Dans le but de contrer cette menace, l'humanité met au point une arme nommée CHARM, combinant la science et la magie. Certaines jeunes femmes, que l'on nomme Lily, semblent pouvoir se synchroniser avec cette arme et ainsi l'utiliser à son maximum. L'institut de formation Lily «Garden» a donc été créé dans diverses régions du monde pour protéger et guider les hommes. Ainsi, nous suivons un groupe de jeunes adolescentes se battant pour la suivie de l'humanité.
L'histoire commence dans un lycée où Makoto Ito est tombé amoureux d'une fille Kotonoha Katsura. Il la voit tous les jours dans le même train qu'ils prennent pour aller au lycée. Sekai Saionji, une amie qui est dans la même classe que Makoto, lui propose de l'aider, malgré ses sentiments pour lui...
À l'occasion de la rentrée des classes, deux jeunes filles se croisent sur le quai de la gare. Fumi se rend au lycée de Matsuoka tandis qu’Akira s'apprête à rejoindre le prestigieux établissement de Fujigaya. Ignorant qu'elles partagent un passé commun, elles engagent une conversation.
Automne 2007, un mois avant le festival du lycée, Haruki Kitahara voit se décomposer le club de musique dans lequel il était guitariste remplaçant. Comme un chant du cygne, il entame un dernier morceau à la guitare. À ses dernières notes se mêlent alors celles du piano de la salle voisine, puis une voix féminine mélodieuse.
« Grand frère, on prend vraiment un bain ensemble ? » Et ainsi, une expérience de baignade interdite a commencé. Kazushi, sa sœur et son amie d’enfance – un homme et deux femmes – partagent un bain. Après avoir involontairement «débordé», l’amour secret de la sœur se faite ressentir ?! Il s’agit d’une jeune comédie romantique qui ne vous laissera pas dire « C’est fini ! ». Kazushi, un étudiant vivant seul, s’inquiète de la pérsence de sa sœur et de son amie d’enfance dans son appartement. Ayane, la sœur aînée effrontée et sa sœur cadette, Kotone. Leur présence deviendra une vie ascétique semi-compulsive.
Yosuga no Sora raconte l'histoire des jumeaux Haruka et Sora Kasugano devenus orphelins après la mort de leurs parents dans un accident de voiture. Ils décident donc de tout recommencer dans leur maison secondaire située dans des montages japonaises, là où ils ont passé leurs vacances étant plus jeunes. Beaucoup d'années se sont écoulées depuis. Comment les deux personnages principaux et leurs anciennes connaissances vont elles réagir à ces retrouvailles ? Une longue route les attend. Sora Kasugano saura t-elle faire confiance à d'autres personnes que son frère, pour qui elle éprouve beaucoup d'amour ?
Matsuzaka Satou a longuement eu la réputation d'enchaîner les petits amis jusqu'au jour où elle rencontre l'amour de sa vie, qui n'est autre que l'adorable petite Shio. Depuis, Matsuzaka fait tout pour le bien de leur relation, quitte à recourir à la violence. Mais d'où vient réellement Shio ?
L'histoire nous entraîne à suivre de jeunes femmes, qui n'hésitent pas à montrer leur culotte tout en ayant le regard de mépris...
Après un passé obscur, Yûji Kazami espère trouver une vie de lycéen banal à l’académie Mihama. Mais cette école presque déserte n’a rien d’habituel, et Yûji découvrira que, malgré les apparences, ses occupantes et lui ont bien des choses en commun…
Un amour sans espoir… un amour douloureux… un amour à sens unique… L’amour est-il véritablement magique ? Hanabi Yasuraoka est en deuxième année au lycée, et désespérément amoureuse de la mauvaise personne. Et elle serait prête à faire n’importe quoi pour être avec elle, quitte à faire du mal à ses proches. Une histoire d’amour à la fois pure et dérangeante.
Miaka est soumise au stress des examens. Un jour, en accompagnant Yui, sa meilleure amie, à la bibliothèque, elle trouve un livre nommé "Les écrits des quatre dieux du ciel et de la terre". Mais ce livre est magique, et les deux jeunes filles sont aspirées dedans. Dans le monde du livre, qui se passe dans une sorte de Chine ancienne, elle devient la prêtresse de Suzaku, un des 4 dieux, protecteur du pays Sud, avec pour charge de protéger le royaume. Mais la prêtresse de Seiryu, dieu protecteur d'un pays rival, n'est nulle autre que Yui...
Yuru, le chasseur, vit séparé de sa sœur jumelle Asa, enfermée dans une prison pour satisfaire un rituel. Tous deux ignorent la vérité sur leur naissance et lorsque leur paisible village est attaqué par de mystérieux ennemis, Yuru découvre qu’il peut commander un puissant duo de créatures appelé “Tsugai”.
Les années collège dans la ville de Kawagoe ! Kôtarô travaille dans une librairie et il aimerait devenir écrivain. Akane est une jeune fille pleine d’énergie qui adore courir. Ils se retrouvent tous les deux dans la même classe et doivent s’occuper des équipements d’un festival de sport. Une relation naît doucement, malgré leurs caractères opposés, notamment à travers les nombreux échanges qu’ils ont sur LINE, un logiciel de discussion.
Yuki, une étudiante sourde, se retrouve un jour en difficulté lorsqu'un élève de son école, Itsuomi, lui vient en aide. Pourtant, Itsuomi n'est pas du tout déconcerté par le fait qu'elle n'entende pas et interagit naturellement avec elle. Alors qu'il l’entraîne progressivement vers un nouveau monde, Yuki commence à éprouver des sentiments pour Itsuomi…
Mireille Bouquet, une tueuse à gages qui a la réputation d'être très efficace, reçoit un jour un mail d'une certaine Kirika Yūmura. Mireille décide d'aller à la rencontre de cette personne afin d'en savoir plus. Une « relation de travail » se forme alors entre Mireille et Kirika, qui est sûre de détenir un grand secret en sa possession, mais n'a aucun souvenir sur elle ou sur ses actes dans le passé. Seul le nom de Noir lui semble familier. Commence alors pour ces deux personnes un péril pour découvrir la vérité.
Yoshida, 26 ans et salarié dans une grande entreprise, a passé sa soirée à noyer son chagrin après une rupture sentimentale tout particulièrement difficile. En rentrant chez lui, il recueille une lycéenne ayant fugué, Sayu, qu’il héberge pour la nuit. Le lendemain, Yoshida accepte qu’elle reste chez lui, à condition que leurs relations restent strictement amicales. Chacun va ainsi aider l’autre à se reconstruire…
Kazuki Muto est un lycéen sans histoire. Un jour, il sauve une jeune fille d'un monstre, mais il meurt pendant le combat. Cette demoiselle, nommée Tokiko, touché par ce sacrifice, le ressuscite avec un Kakugane. Kazuki découvre alors que Tokiko est un chevalier alchimiste dont la mission est de tuer les homonculus qui menacent les êtres humains. Doté de grands pouvoirs grâce au Kakugane, Kazuki décide d'aider l'alchimiste dans sa mission d'éradication. Un combat à mort contre les homonculus commence alors....
Deux journalistes, Mino-san et sa partenaire, sont envoyés pour couvrir un évènement culturel dans la ville de Shanghai. Cette dernière se retrouve finalement seule au milieu de cette manifestation festive. Elle est brutalement mêlée à une situation critique au mauvais endroit, au mauvais moment, mais c'est alors que surgit Canaan, une jeune mercenaire.
Afin d'acquérir les compétences nécessaires pour surpasser son père, Baki intègre la prison d'État d'Arizona pour affronter un prisonnier, le redoutable "M. Unchained".
