

Un an après les événements de la première saison, un Digimon virus appelé Diaboromon apparaît et commence à attaquer Internet. Les enfants et leurs Digimon s'unissent à nouveau pour l'empêcher de détruire tous les réseaux de communication de la planète.

Meicoomon se déchaîne après avoir vu Meiko Mochizuki se faire blesser par l'homme ressemblant à Gennai. « Il aurait mieux valu que tu ne naisses pas… » Meicoomon disparaît dans le monde réel, qui s'est depuis déformé. Possédant un pouvoir écrasant, il est la clé de la destruction du monde.

En arrivant dans le monde numérique après le « reboot », les DigiDestinés sont poursuivis par un nouveau méchant. Pendant ce temps, Sora est troublée par l'indifférence de son partenaire Digimon à son égard.

Après avoir vu la transformation abrupte de Meicoomon et le meurtre de Leomon, Agumon et les autres Digimon sont maintenus isolés dans le bureau de Koushiro afin de les empêcher d'être infectés, mais des signes d'infection commencent à apparaître chez Patamon.

Le monde a commencé à s'effondrer. Le déchaîné Meicoomon absorbe Tailmon, qui a subi une sombre évolution, et se transforme en l'immensément puissant Ordinemon. Conformément aux prévisions d'Yggdrasil, le monde réel est sur le point d'être englouti par le monde numérique. Pendant ce temps, l'homéostasie considère qu'Ordinemon est hors de contrôle et met en place son plan final qui englobera le monde réel. Le temps est venu pour les DigiDestinés de prendre une décision finale. Quel avenir choisiront-ils pour eux-mêmes ?

Diaboromon fait un retour sur le Net, et les Digi-sauveurs sont appelés à agir, ignorant que Diaboromon a encore quelques tours dans sa manche depuis leur dernière rencontre.

« Mon objectif est détruire ce monde ! » Shin perd le contrôle de son Geass. Akito est résolu à l'affronter dans un ultime combat fratricide. L'unité wZERO a certes réussi à réduire les troupes euro-britanniennes de deux tiers grâce à la bombe larguée par Yukiya, mais elle est toujours en position de faiblesse, recluse dans le château de Weisswolf. Ashley, un ancien ennemi de l'unité, change de camp et vient leur prêter main forte. Avant de partir pour l'ultime combat, Akito coupe sa tresse et la donne à Leila. Quand les âmes sont unies, le secret de l'avenir est mis à nu. Le futur qui les attend sera-t-il celui de l'espoir ou du désespoir ? La bataille de la destinée touche à sa fin. Voici venir la conclusion de Code Geass - Akito the Exiled !

Dans une société où les héros et les vilains s'affrontent continuellement au nom de la paix et du chaos, Deku, un étudiant du lycée U.A. qui aspire à devenir le meilleur héros possible, affronte celui qui imite le héros qu'il admire depuis longtemps. Deku et les autres élèves de la classe 1-A du lycée U.A. pourront-ils protéger le monde en mettant fin aux agissements de Dark Might, l'homme qui prétend être le nouveau symbole de la paix ?

An 228 du calendrier révolutionnaire : Le mystérieux conseiller militaire Julius Kingsley, épaulé par Suzaku Kururugi, un Knight of Rounds, prend le commandement de toutes les forces armées de Britania avec l'accord de Sa Majesté l'empereur. Sa prise de fonction et de pouvoir sème le trouble au sein de la population europienne. Shin Hyûga Shaing assiste calmement aux opérations de Lord Kingsley et en profite pour placer ses pions en vue de réaliser ses ambitions personnelles.

Suite au combat contre Belial Vamdemon, le Digital World s'est refermé et les Élus ont repris leur vie dans le monde réel. Mais un jour, Kuwagamon apparaît subitement à Odaiba. Témoin de la scène, Taichi Yagami, désormais 17 ans, le prend en chasse, seul, mais il comprend bien vite qu'il est impuissant sans son partenaire. C'est alors qu'un miracle se produit.

La guerre entre Britania et la République Unie d’Europia arrive à un point décisif. Tandis que le groupe terroriste de la Flotte de l’Arche sème le chaos en Europia, l’unité « W-Zero », dirigé par Akito Hyûga, contre-attaque et s’en prend au quartier général de la Flotte de l’Arche : un dirigeable géant nommé Gallia Grande. Alors que la bataille fait rage, Leila perd tout contact avec Akito. Au même moment, le Saint-Empire de Britania profite de l’absence d’Akito et de ses soldats, pour attaquer le château Weiswolf, un des points stratégiques d’Europia. Leila assiste, impuissante, à l’invasion de Shin et des Chevaliers de Saint-Michel. Va-t-il réussir à prendre possession du Château ?

Un énorme vaisseau spatial atterrit sur Terre. À son bord, une armée de soldats qui commencent à semer le chaos sur la planète. Après avoir rassemblé les sept Dragon Ball, le chef de cette armée demande à Shenron de lui redonner sa jeunesse passée. Ayant retrouvé sa vigueur d'antan, Slug s'oppose à Songoku et à ses amis. Il s'ensuit toute une série de combats. De manière inattendue, Songohan va tirer son épingle du jeu dans une situation plutôt désespérée.

Après avoir battu Freezer, Songoku revient sur Terre pour retrouver sa famille et ses amis. Malheureusement, son retour ne sera pas de tout repos : Cooler, le frère de Freezer, débarque sur Terre pour le venger. Songoku, blessé, est obligé de se cacher pendant que Songohan part chercher des haricots magiques. Une fois rétabli, l'affrontement éclate à nouveau. Cooler a le dessus jusqu'au moment où Songoku se transforme en super guerrier...

Après avoir forcé l'ancien chef des chevaliers à se suicider, Shin est promu commandant des Chevaliers de Saint-Michel. Pendant ce temps, l'unité « W-Zero » tombe dans une embuscade dirigée par Shin, le frère d'Akito. Mais ce dernier parvient, grâce à son pouvoir du Geass, à repousser l'assaut adverse… Au même moment, un étrange convoi entre en gare de St Petersbourg avec à son bord un homme dont le visage reste caché. Qui est donc ce mystérieux personnage ? Akito arrivera-t-il a déchaîner son pouvoir du Geass contre son frère ?

La guerre civile fait rage sur Vénus. La planète est déchirée entre Ishtar et Aphrodia et les civils doivent endurer couvre-feu et patrouilles continuels. Suzanne Summers, journaliste, arrive sur Vénus pour couvrir la guerre civile qui sévit. Elle rencontre Hiro qui fait partie d'un commando rebelle de motards, et se trouve alors impliquée dans l'affaire…

Scarlet, une princesse médiévale experte en combat à l'épée se lance dans une périlleuse quête pour venger la mort de son père. Son plan échoue et grièvement blessée elle se retrouve projetée dans un autre monde, le Pays des Morts. Elle va croiser la route d'un jeune homme idéaliste de notre époque, qui non seulement l'aide à guérir mais lui laisse également entrevoir qu'un monde sans rancœur ni colère est possible. Face au meurtrier de son père, Scarlet devra alors mener son plus grand combat : briser le cycle de la haine et donner un sens à sa vie en dépassant son désir de vengeance.

Le moment est venu pour Ryuken, le maître du Hokuto Shinken, de désigner un successeur parmi ses quatre fils. Ce sera Kenshiro qui héritera de ce titre. Malgré le danger inhérent à cette charge, sa compagne Julia décide de rester aux côtés de l'homme qu'elle aime. Mais Shin, l'une des puissantes étoiles de l'école Nanto, brûlant de désir pour Julia et attisé par la haine et la jalousie, enlève la jeune femme après avoir défait Kenshiro lors d'un combat qui laissera à l'héritier du Hokuto sept cicatrices sur le torse. Retenue par Shin loin de Kenshiro, Julia décide de mettre fin à ses jours. Mais en se jetant dans le vide, sa véritable destinée va lui être révélée...

Sur une Terre ravagée par un holocauste nucléaire, les plus forts sont appelés à survivre. Les plus grandes écoles d'art martiaux telles que le hokuto et le nanto sont les seules à pouvoir former les champions d'un nouvel ordre. Mais l'ambition conduit nombre d'entre eux à vouloir dominer ce monde de chaos et de misère. C'est le cas de Raoul qui s'auto proclame Roi du Hokuto. Un seul homme est capable de le vaincre : Ken. Laissé pour mort et couvert des sept cicatrices, il part à la recherche de sa bien-aimée Julia...

Lorsque deux androïdes de combat défectueux sont accidentellement lâchés lors d'une mission "Terminate at All Costs" contre la petite-fille insoupçonnée de leur créateur, une ville entière devient le champ de bataille et même l'armée ne peut les arrêter ! Le seul espoir de la fille : Sybil, une journaliste indépendante qui cherche à obtenir le scoop de sa vie, si elle peut, d'une façon ou d'une autre, garder elle-même et son sujet en vie assez longtemps pour déposer un rapport. Mais d'abord, elle doit se rappeler de s'habiller !

Char tente de prendre possession de l'astéroïde Luna 5 durant la bataille de Gryps. Mission réussie, il parvient à le faire lancer sur Lhassa, au Tibet, là où se trouvait le nouveau QG de la Fédération. Adenauer Paraya, un politicien envoyé par la Fédération, a pour mission de négocier secrètement avec Char Aznable afin qu'il n'y ait plus de conflit. La négociation tourne à l'avantage de Char qui rachète l'astéroïde Axis à l'aide d'une très forte somme en or. Son plan, projeter Axis sur Terre pour anéantir toute vie dessus et accélérer l'évolution de l'humanité en NewTypes. Bright Noah, Amuro Ray, et tous les membres de Londo Bell devront alors tout faire pour empêcher cette catastrophe.

Ikoma et les réfugiés de la Forteresse de fer poursuivent leur combat à Unato, où ils rejoignent l'alliance pour libérer la région des hordes de Kabane.