La série fait office de suite au film Les Nouveaux Héros.
Très doué, Peter Parker, est à 15 ans la risée de tous ses camarades au lycée. Lors d’une visite de classe dans les Entreprises Osborn, il est mordu par une araignée génétiquement modifiée. Quelques jours plus tard, l'adolescent réalise qu’il est doté d’un sixième sens hors du commun qui le prévient de tous les dangers et lui donne une force surhumaine et de super pouvoirs qu’il met au service des autres. Peter devient un justicier. Spider-Man est né !
Le docteur Fatalis, dans sa guerre pour conquérir l'univers, a essayé de s'approprier l'épée de l'Infini qui a le pouvoir de changer la réalité. Il est arrêté par Iron Man, mais dans la bataille l'épée s'est brisée en plusieurs morceaux. Il crée donc une alliance composée de super-vilains de la Lethal Legion, de MODOK et de l'Abomination, afin de récupérer les morceaux dispersés l'épée de l'Infini brisée. Chacun d'entre eux, possède de dangereux pouvoirs. L'équipe de Fatalis inclus aussi les résidents de Villainville, laquelle a été séparée de Superhero City par une muraille géante érigée au début de la série. Une fois de plus, Iron Man, à la tête de la Super Hero Squad, composée de Hulk, le Faucon, le Surfer d'argent, Thor et Wolverine, va tenter de s'opposer à ses plans.
Sous les mers, dans l’espace ou au plus profond de la jungle, Batman, le justicier masqué de Gotham qui a juré de combattre le mal où qu’il se manifeste, fait désormais alliance avec de nombreux autres superhéros le temps d’une aventure haute en couleurs et en action, pour vaincre de terribles supervilains. C’est ainsi qu’il lutte le temps d’histoires uniques et rythmées aux côtés d’autres légendes DC telles Aquaman, Green Arrow, Plastic Man ou encore Blue Beetle…
Peter Quill est Star-Lord, un aventurier impétueux qui, pour sauver l'univers de ses plus grandes menaces, s'associe à un quatuor de marginaux disparates, d'un raton laveur d'apparence humaine appelé Rocket Raccoon , d'un humanoïde végétal appelé Groot, l'énigmatique experte et chasseuse Gamora et du rude guerrier Drax le destructeur.
Robin, Cyborg, Starfire, Raven et Changelin, alias les Teen Titans, sont des adolescents à priori sans histoires, sauf qu’ils ont pour hobby de sauver le monde !
Kaz et Oliver se retrouvent à Mighty Med, un hôpital secret pour super-héros. Ainsi, ils découvrent que leurs personnages préférés sont bien réels et qu'ils vivent parmi eux. Mais ces deux garçons comme les autres n'ont pas de super-pouvoir, ce sont des "Normos". Ils vont devoir apprendre à jongler entre deux mondes, avec l'aide de Skylar Storm, une super-héroïne, et du très curieux Alan Diaz, le neveu du chef de l'hôpital. L'amitié des deux garçons et leur connaissance des super-héros leur confèrent un extraordinaire pouvoir et leur permettront de sauver les gens qui sauvent les gens.
Peter Parker, un jeune étudiant, est un jour mordu par une araignée radioactive qui lui donne des super pouvoirs. En mémoire de son oncle Ben, mort dont il se sent responsable, il lutte contre le crime sous l'identité de Spider-Man, l'homme araignée. Pour subvenir à ses besoins et ceux de sa Tante May, il gagne de l'argent en vendant les photos qu'il prend de ses exploits en Spider-Man, au patron du Daily Bugle, Jonah Jameson. Ce dernier tente par tous les moyens de découvrir qui est Spider-Man, persuadé que celui-ci est un danger pour la société. Peter devra affronter de nombreux ennemis qui veulent le détruire tout en gardant son identité secrète pour préserver ses proches.
Un soir, alors qu'il travaille dans son laboratoire, Barry Allen est victime d'un accident. Electrocuté et aspergé de produits chimiques, il perd conscience. A son réveil, il découvre qu'il a le pouvoir de se déplacer à une vitesse extraordinaire. Christina McGee, une de ses collègues, va désormais l'aider à canaliser son don et à devenir... Flash !
Marvel’s Avengers Assemble est une série animée racontant des histoires directement en lien avec le film The Avengers. Iron Man est le leader de cette équipe réunissant les plus puissants des superhéros: Hulk, Captain America, Thor, Hawkeye, Black Widow et un nouveau venu, Falcon. Ils allieront leurs forces face à des menaces qu'un seul ne peut pas vaincre. Quand les Avengers se réunissent, le mal n'a aucune chance de l'emporter.
Dexter Douglas est un garçon de 16 ans, passionné d'informatique. Un jour, un bogue de son ordinateur lui confère des pouvoirs : l'information sur Internet, la force, l'endurance, l'agilité et l'instinct d'un criminel. Il est désormais capable de se transformer en un super-héros, Freakazoid, à l'instar de personnages comme Peter Parker.
Peter Parker est un jeune étudiant qui a hérité de formidables superpouvoirs depuis le jour où il a été piqué par une araignée génétiquement modifiée. Il peut désormais adhérer aux murs, tisser une toile pour se balancer de building en building et est doté d'une force surhumaine... Sous le costume de Spiderman, il protège les habitants de New York de toutes sortes de menaces. Mais il doit aussi songer à trouver un équilibre entre sa vie aventureuse et sa vie privée. Peter est en effet amoureux de Mary Jane Watson, sa meilleure amie, mais son secret l'empeche de passer autant de temps avec elle qu'il le souhaiterait. Le meilleur ami de notre héros est Harry Osborn, qui hait en même temps l'homme araignée, qu'il juge pour responsable de la mort de son père, Norman Osborn, dont il ignore qu'il était en fait un dangereux criminel costumé.
À Super Hero High, une école réservée aux super-héros, les célèbres super-héros de DC Comics sont venus pour apprendre à maîtriser leurs super-pouvoirs et assister à des cours personnalisés.
Les aventures de Virgil, un jeune garçon afro-américain, qui se retrouve impliqué dans une guerre de gangs. Ces jeunes cassent des barils contenant un produit chimique et le gaz s'en échappant provoque des mutations sur toutes les personnes aux environs, leur donnant des super-pouvoirs. Virgil gagne des pouvoirs électromagnétiques et devient ainsi le défenseur de la veuve et l'orphelin contre les mutants. Dans sa tâche, il est aidé de son fidèle ami Richie, accro à la technologie.
Dans cette équipe encore jamais vue de Hulk, sa cousine She-Hulk, A-Bomb, Red Hulk et Skaar, les super-héros les plus puissants de Marvel forment une famille excentrique, travaillant ensemble pour faire face aux menaces trop énormes pour être gérées par d'autres héros.
L'histoire débute lorsque trois enfants (Drew, Jo et Roland) font le pari de rentrer dans un manoir réputé hanté. Une fois à l'intérieur, ils y trouvent un vieil orgue étrange. Jo, la fille du groupe, se met à jouer un morceau qui, sans le savoir, déclenche un mécanisme libérant de l'instrument un étrange génie, un peu clown, nommé Flabber. Reconnaissant envers ses libérateurs, il accepte de leur exaucer un vœu. Les trois enfants se révèlent être des fans du comic The Beetleborgs et demandent donc à Flabber qu'il les transforme en leurs héros préférés. Malheureusement, en transformant les jeunes gens en super-héros, il libère en même temps du comic les méchants, les Magniavores. Commence alors une bataille dans le monde réel.
Le magnat de l'industrie, Tony Stark, lutte contre le mal. Pour cela, il est paré d'une armure hors du commun et devient l'invincible Iron Man..
C'est la rentrée des classes pour Peter Parker, un lycéen de 16 ans très doué en sciences mais également l'objet de risée dans son lycée. Ce que tous ignorent par contre, c'est que quelques mois plus tôt, Peter Parker s'est fait piquer par une araignée génétiquement modifiée lui conférant des super pouvoirs. C'est ainsi qu'il est devenu Spider-Man, un super-héros qui a promis de lutter contre le mal dans la ville de New-York suite au meurtre de son oncle Ben.
Tony Stark est un adolescent surdoué, inventeur de génie et fils du milliardaire Howard Stark, qui dirige la société de technologie Stark Industries. Usant de ses connaissances et de l'aide de son ami James Rhodes, Tony développe en secret une armure censée révolutionner la technologie. Peu après, cependant, son père périt dans un accident d'avion, vraisemblablement orchestré par son associé, Obadiah Stane. Ce dernier prend alors le contrôle de la société, Tony étant encore mineur, et commence à aller à l'encontre des principes d'Howard, fabriquant des armes lethal sans tenir compte des risques.Scandalisé et cardiaque suite à l'accident, Tony décide d'utiliser son armure comme arme pour lutter contre les agissements de Stane. Cependant, rapidement, sa chasse contre Stane se transforme en lutte pour défendre l'ensemble de la population. Sous le surnom d'Iron Man, Tony commence à lutter, non seulement contre Stane, mais aussi contre différents ennemis, notamment le Mandarin, un mystérieux personnage en armure recherchant des bagues...
Envoyés incognitos dans la ville de Secret Shores, Phoebe et Max font face à une nouvelle menace. Ils décident d'emmener avec eux Chloé, leur petite sœur, afin de l'aider à améliorer ses pouvoirs et l'entraîner durant cette mission.
